أجرت جامعة لعيون الاسلامية تعديلات في طاقمها الأكاديمي والإداري تم بموجبها تغيير عمداء كلياتها الثلاث فضلا عن عميد الدراسات العليا.
حيث تم تعيين الدكتور محمد سيدي محمد أحمده؛ عميدا لكلية أصول الدين، وهو أستاذ مكتتب لنفس الكلية في تخصص السيرة النبوية والتاريخ الإسلامي، وشغل منذ تأسيس الجامعة رئيس قسم الحضارة والفكر الإسلامي ورئيس مصلحة الجودة والمتابعة ثم مدير البحث العلمي.
كما تم تعيين الدكتور أحمدَ إدومو نافع؛ عميدا لكلية الشريعة، وهو أستاذ الإقتصاد الإسلامي ورئيس قسمه في نفس الكلية إبان تأسيس الجامعة، ثم عين عميدا للدراسات العليا.
أما الكلية الثالثة وهي كلية اللغة العربية والعلوم الإنسانية فقد عين الدكتور أحمد محمود افاه؛ عميدا لها، وهو أستاذ مختص في الإعلام وعند تأسيس الجامعة عين نائبا لعميد الكلية، حيث مر لمدة سنتين بالمعهد العالي للدراسات والبحوث الاسلامية كمدير عام مساعد.
من جهة أخرى تم تعيين الدكتور سيدي محمد المصطفى اجيد؛ عميدا للدراسات العليا، وهو أستاذ مختص في علم الاجتماع، وشغل منذ تأسيس الجامعة منصب الأمين العام لكلية اللغة العربية ثم الأمين العام لكلية الشريعة قبل تعيينه اليوم.